Работала на ИП без трудового договора, через 2 месяца как ушла обвинили в недостаче

Здравствуйте! Я работала на ИП с августа 2011 без трудового договора. В ноябре 2012 года я забеременела, попросила ее о трудовом договоре, хотя бы чтобы оформила с января 2013 года, она отказала, в конце января я ушла... Я написала в прокуратуру о ее нарушении, ее обязали оформить трудовой договор! В конце февраля она написала на меня в милицию на недостачу, хотя там уже после моего ухода работают другие продавцы. В милиции ей отказали. Договор она мне прислала на 6000 руб, но такой договор я не согласна, как мне быть? Если я подпишу договор, она может мне предъявить через суд недостачу? Или лучше мне самой подать на нее в суд, за неиспользованный отпуск за 2 года, за простой, и получается я не доработала из-за нее до 30 недель, чтобы мне выйти как положено в декретный отпуск и чтоб не прервался трудовой стаж.... спасибо...